| Pastorate of West Nigula Church | — | 1/3 Nigula tee, Nigula küla, 90807 | — | |
| Paluküla kirik | — | Paluküla, 92420 | — | |
| Paldiski Suurmärter Panteleimoni kirik | — | 4 Muuli, Paldiski, 76805 | — | |
| Paldiski Radoneži vaga Sergi kirik | — | 1 Tuule, Paldiski, 76806 | — | |
| Paldiski Püha Georgi kirik | — | 2 Pakri, Paldiski, 76806 | — | |
| Palade priikoguduse palvela | — | Palade küla, 92301 | — | |
| Paistu Maarja kirik | — | 1 Paistu tee, Paistu küla, 69601 | — | |
| Paide Uusapostlik kirik | — | 64 Pärnu, Paide, 72718 | — | |
| Paide Metodisti kirik | — | 61 Pärnu, Paide, 72712 | — | |
| Paide baptistikoguduse palvela | — | 24 Jõe, Paide, 72717 | — | |
| Paadrema Püha Kolmainu kirik | — | Paadrema küla, 88202 | — | |
| Otepää Palveränduri kirik | — | 15 Pärna, Otepää, 67404 | — | |
| Otepää kirik | — | 3 Kanepi tee, Otepää, 67403 | — | |
| Osmussaare kabel | — | — | — | |
| Orthodox Church of the Narva Icon of the Mother of God | — | 39 Rakvere, Narva, 20609 | — | |
| Orthodox Church of St. Nicholas | — | 14/1 Tartu, Mustvee, 49604 | — | |
| Orthodox church of St John of Kronstadt in Loksa | — | 17a Posti, Loksa, 74805 | — | |
| Orthodox Church of Resurrection | — | 11/1 Linda, Narva, 20308 | — | |
| Orissaare nelipühi koguduse hoone | — | 14 Kuivastu mnt, Orissaare alevik, 94601 | — | |
| Obinitsa Issanda Muutmise kirik | — | 42 Kesktänav, Obinitsa küla, 65301 | — | |
| Obinitsa Eukterion | — | 10/1 Muuseumi, Obinitsa küla, 65301 | — | |
| Nõva kirik | — | Nõva küla, 91101 | — | |
| Nõo Püha Kolmainu kirik | — | 2 Liivamäe, Nõo alevik, 61601 | — | |
| Nõmme vennastekoguduse palvela | — | 48 Harku, Tallinn, 11612 | — | |
| Nõmme Saksa Lunastaja kirik | — | 10/1 Õie, Tallinn, 11615 | — | |
| Nõmme Rahu kirik | — | 5/1 Võsu, Tallinn, 11619 | — | |
| Nõmme Baptistikogudus | — | 4 Puuvilja, Tallinn, 11618 | — | |
| Noarootsi Püha Katariina kirik | — | Hosby küla, 91215 | — | |
| Nissi kirik | — | 66 Nissi tee, Riisipere alevik, 76202 | — | |
| Nelipühi kirik | — | 15 Jaama, Abja-Paluoja, 69403 | — | |
| Narva-Jõesuu Püha Suurvürst Vladimiri kirik | — | 63 Vabaduse, Narva-Jõesuu, 29023 | — | |
| Narva Mihkli kirik | — | 22 Kreenholmi, Narva, 21008 | — | |
| Narva Kristlik Nelipühi kogudus „Immanuel“ | — | 1 Kalda, Narva | — | |
| Narva Kristlik Kogudus Jumala Sõna | — | — | — | |
| Narva Kaheteistkümne Püha Apostli kirik | — | 4 Mõisa, Narva, 21006 | — | |
| Narva EKB koguduse palvela | — | 13 Rakvere, Narva, 20609 | — | |
| Narva Aleksandri Suurkirik | — | 9 Kiriku, Narva, 20308 | — | |
| Naissaare Maarja kirik | — | 58 Männiku tee, Lõunaküla, 74022 | — | |
| Mõniste-Ritsiku Ristija Johannese kirik | — | 19 Ritsiku, Varstu alevik, 66101 | — | |
| Mõisaküla õigeusu kirik | — | 37 Kiikre, Mõisaküla, 69302 | — | |
| Mõisaküla Maarja-Magdaleena kirik | — | 65 Pärnu, Mõisaküla, 69302 | — | |
| Märjamaa kirik | — | 22a Pärnu mnt, Märjamaa alev, 78301 | — | |
| Mänspe kirik | — | Mänspe küla, 92054 | — | |
| Männamaa (Ühtri) baptisti palvemaja | — | Ühtri küla, 92163 | — | |
| Mähe Kirik | — | 32 Pojengi tee, Tallinn, 11913 | — | |
| Mustvee vanausuliste palvela | — | 2 Lohu, Mustvee, 49604 | — | |
| Mustvee Betaania koguduse palvemaja | — | 5 Tähe, Mustvee, 49603 | — | |
| Mustjala Prohvet Eeliase kirik | — | 4 Vene, Mustjala küla, 93601 | — | |
| Mustjala Anna kirik | — | 3 Kiriku, Mustjala küla, 93601 | — | |
| Mustamäe Kristlik Vabakogudus | — | 8 Mustamäe tee | — | |