| Skuodo Švč. Trejybės bažnyčia | — | 12 Gedimino g., Skuodas, 98126 | — | |
| Skuodo evangelikų liuteronų bažnyčia | — | 1 Vytauto g., Skuodas | — | |
| Skuodo Aleksandro Neviškio cerkvė | — | 13 Gedimino g., Skuodas, 98140 | — | |
| Skudutiškio Švč. Trejybės bažnyčia | — | 13 Bažnyčios g., Skudutiškis, 33322 | — | |
| Skudutiškio koplyčia | — | — | — | |
| Skriaudžių Šv. Lauryno bažnyčia | — | 7 Ramybės g., Skriaudžiai, 59277 | — | |
| Skrebotiškio Švč. Jėzaus Širdies bažnyčia | — | 4, Skrebotiškis | — | |
| Skrebiškių koplyčia | — | 1 Kraštų g., Skrebiškiai | — | |
| Skirsnemunės Šv. Jurgio bažnyčia | — | 8 Mikalojaus Gadliausko g., Skirsnemunė | — | |
| Skirsnemunės evangelikų liuteronų bažnyčia | — | 68 Nemuno g., Skirsnemunė, 74485 | — | |
| Skiemonių Švč. Mergelės Marijos bažnyčia | — | 4 Malūno g., Skiemonys, 29223 | — | |
| Skaudvilės Šv. Kryžiaus bažnyčia | — | 2 Tauragės g., Skaudvilė, 73423 | — | |
| Skaudvilės evangelikų liuteronų bažnyčia | — | 22 Kelmės g., Skaudvilė, 73435 | — | |
| Skaruliai St. Ann church | — | 53 Skarulių g., Jonava, 55198 | — | |
| Skardupių Švč. Mergelės Marijos, Krikščionių Pagalbos, bažnyčia | — | 36 Bažnyčios g., Skardupiai, 69330 | — | |
| Skapiškio Šv. Hiacinto (Jackaus) bažnyčia | — | 2A Dariaus ir Girėno g., Skapiškis | — | |
| Skaidiškių Šv. Faustinos koplyčia | — | 1C Šv. Faustinos g., Skaidiškės, 13267 | — | |
| Sintautų Švč. Mergelės Marijos Ėmimo į dangų bažnyčia | — | 37 P. Vaičaičio g., Sintautai, 71336 | — | |
| Simno Švč. Mergelės Marijos Ėmimo į dangų bažnyčia | — | 2 Kreivoji g., Simnas, 64312 | — | |
| Silenai church of the Blessed Virgin Mary | — | 3 Šaltinio g., Šilėnai, 14206 | — | |
| Siesikų Šv. apaštalo Baltramiejaus bažnyčia | — | 9 Nepriklausomybės g., Siesikai | — | |
| Siesikų kapinių koplyčia | — | — | — | |
| Sidarių šv. Jono sentikių cerkvė | — | 7 Kaimynų g., Sidariai, 82462 | — | |
| Sidabravo Švč. Trejybės bažnyčia | — | 12 Vaižganto g., Sidabravas, 82251 | — | |
| Seredžiaus Šv. Jono Krikštytojo bažnyčia | — | 17A Palemono g., Seredžius | — | |
| Septynios viltys | — | — | — | |
| Septintosios Dienos Adventistų Bažnyčia | — | 67 Šilalės g., Tauragė, 72208 | — | |
| Senųjų Trakų Viešpaties Apreiškimo Švč. Mergelei Marijai ir Šv. Benedikto bažnyčia | — | — | — | |
| Sentikių maldos namai | — | 176 Vilniaus g., Maseliškės | — | |
| Sentikių maldos namai | — | 24 Giedraičių g., Vilnius, 09301 | — | |
| Senosios Varėnos Šv. arkangelo Mykolo bažnyčia | — | 196 Vytauto g., Senoji Varėna, 65490 | — | |
| Senoji švč. Mergelės Marijos, Jūrų Žvaigždės bažnyčia | — | 30 Paupio g., Palanga | — | |
| Senoji Pažėrų Švč. Jėzaus Širdies bažnyčia | — | 3 Andriaus Gustaičio g., Pažėrai | — | |
| Senoji Aleksoto Šv. Kazimiero bažnyčia | — | 35 Antakalnio g., Kaunas, 46275 | — | |
| Semeliškių Švč. Mergelės Marijos nekalto prasidėjimo koplyčia | — | — | — | |
| Semeliškių Šv. Nikolajaus Stebukladario cerkvė | — | 75 Trakų g., Semeliškės, 21302 | — | |
| Semeliškių Šv. Lauryno bažnyčia | — | 22 Užupio g., Semeliškės, 21301 | — | |
| Seirijų Švč. Mergelės Marijos Škaplierinės bažnyčia | — | 35 Vytauto g., Seirijai, 67227 | — | |
| Sedos Švč. Mergelės Marijos Ėmimo į dangų bažnyčia | — | 1 Varduvos g., Seda, 89380 | — | |
| Sedos Šv. Jono Nepomuko bažnyčia | — | 48 Vytauto g., Seda, 89380 | — | |
| Saugų Šv. Kazimiero bažnyčia | — | 23A Tilžės g., Saugos | — | |
| Saugų evangelikų liuteronų bažnyčia | — | 23 Tilžės g., Saugos | — | |
| Sasnavos Švč. Mergelės Marijos Vardo bažnyčia | — | 46D Sūduvos g., Sasnava, 69479 | — | |
| Sartininkų Šv. Jurgio bažnyčia | — | 2 Tylos g., Sartininkai, 73245 | — | |
| Sartininkų evangelikų liuteronų bažnyčia | — | 26 Pieninės g., Sartininkai, 73245 | — | |
| Santariškių Dievo Gailestingumo koplyčia | — | — | — | |
| Santaikos Kristaus Karaliaus bažnyčia | — | 19 Santaikos g., Santaika | — | |
| Sangrūdos Šv. Kūdikėlio Jėzaus Teresės bažnyčia | — | 5 Bažnyčios g., Sangrūda, 69265 | — | |
| Salų Šv. Kryžiaus bažnyčia | — | 11 Kaštonų g., Salos, 42314 | — | |
| Salų dvaro sodybos koplyčia | — | — | — | |