| 예랑교회 | 충북 충주시 | — | 충청북도 충주시 대소원면 대소원1길 51-1 | — | |
| 예루살렘교회 | 충북 청주시 상당구 | — | 충청북도 청주시 상당구 용담로63번길 35 | — | |
| 예명교회 | 충북 청주시 흥덕구 | — | 충청북도 청주시 흥덕구 풍년로206번길 48 | — | |
| 예복교회 | 충북 제천시 | — | 충청북도 제천시 의병대로12길 32 | — | |
| 예본교회 | 충북 청주시 흥덕구 | 장로교 | 충청북도 청주시 흥덕구 풍산로148번길 15 | — | |
| 예본교회 | 충북 청주시 서원구 | 예장통합 | 충청북도 청주시 서원구 성화로 117 (죽림동) 2동 | 한봉섭 목사 | |
| 예빛교회 | 충북 청주시 청원구 | — | 충청북도 청주시 청원구 1순환로339번길 20 | — | |
| 예사랑교회 | 충북 제천시 | 기감 | 충청북도 제천시 하소로1안길 5 (하소동) | 변영권 목사 | |
| 예삶순복음교회 | 충북 청주시 흥덕구 | 순복음 | 충청북도 청주시 흥덕구 직지대로 751 3층 | — | |
| 예성감리교회 | 충북 충주시 | 기감 | 충청북도 충주시 예성13길 10 | — | |
| 예성교회 | 충북 충주시 | 예장통합 | 충청북도 충주시 대흥2길 4 (교현동) | 추성은 목사 | |
| 예성교회 | 충북 충주시 | 기감 | 충청북도 충주시 예성13길 10 (교현동, 예성감리교회) | 임동혁 목사 | |
| 예수그리스도 후기성도교회 상당와드 | 충북 청주시 상당구 | — | 충청북도 청주시 상당구 사직대로361번길 118 | — | |
| 예수그리스도 후기성도교회 제천지부 | 충북 제천시 | — | 충청북도 제천시 숭문로4길 4 | — | |
| 예수그리스도 후기성도교회 충주와드 | 충북 충주시 | — | 충청북도 충주시 용정8길 8 | — | |
| 예수그리스도후기성도교회 흥덕와드 | 충북 청주시 서원구 | — | 충청북도 청주시 서원구 내수동로 111 | — | |
| 예수님닮은교회 | 충북 청주시 서원구 | — | 충청북도 청주시 서원구 서원남로 56-5 | — | |
| 예수동네교회 | 충북 청주시 흥덕구 | — | 충청북도 청주시 흥덕구 복대로 194 | — | |
| 예수로교회 | 충북 청주시 서원구 | — | 충청북도 청주시 서원구 쌍샘로 103 | — | |
| 예수마을교회 | 충북 청주시 흥덕구 | 예장고신 | 충청북도 청주시 흥덕구 강내면 탑연길 42 | 이기환 목사 | |
| 예수마을교회 | 충북 충주시 | 기감 | 충청북도 충주시 원호암4길 20 (호암동, 호라마트) 2층 | 목진수 목사 | |
| 예수마음교회 | 충북 청주시 상당구 | 기감 | 충청북도 청주시 상당구 용암동 2701 101호 | 서영호 목사 | |
| 예수비전교회 | 충북 옥천군 | — | 충청북도 옥천군 옥천읍 문장로 98-43 | — | |
| 예수사랑교회 | 충북 청주시 상당구 | — | 충청북도 청주시 상당구 용암로 3 | — | |
| 예수사랑교회 | 충북 음성군 | — | 충청북도 음성군 음성읍 시장로 54 | — | |
| 예수사랑교회 | 충북 제천시 | — | 충청북도 제천시 신백로 49 | — | |
| 예수사랑교회 | 충북 단양군 | — | 충청북도 단양군 단양읍 삼봉로 312-1 | — | |
| 예수사랑교회 | 충북 청주시 상당구 | — | 충청북도 청주시 상당구 용담로 83 은혜로교회 | — | |
| 예수사랑교회 | 충북 제천시 | — | 충청북도 제천시 백운면 애련로9길 29 | — | |
| 예수생명교회 | 충북 청주시 흥덕구 | — | 충청북도 청주시 흥덕구 성봉로271번길 3 | — | |
| 예수생명교회 | 충북 충주시 | — | 충청북도 충주시 지곡10길 10 | — | |
| 예수소망교회 | 충북 청주시 청원구 | 예장통합 | 충청북도 청주시 청원구 오창읍 구룡6길 46-2 (구룡리, 첫사랑교회) | 이수갑 목사 | |
| 예수소망교회 | 충북 청주시 청원구 | — | 충청북도 청주시 청원구 오창읍 오창대로 141 | — | |
| 예수소망교회 | 충북 청주시 상당구 | — | 충청북도 청주시 상당구 수영로144번길 17 | — | |
| 예수소망교회 | 충북 청주시 상당구 | — | 충청북도 청주시 상당구 중흥로 176 | — | |
| 예수열방교회 | 충북 청주시 서원구 | 장로교 | 충청북도 청주시 서원구 수곡로57번길 16-2 | — | |
| 예수열방교회 | 충북 청주시 청원구 | — | 충청북도 청주시 청원구 율봉로 217-2 | — | |
| 예수영광교회 | 충북 충주시 | — | 충청북도 충주시 형설로 179 | — | |
| 예수재림교회 [이단] | 충북 음성군 | 재림교회 | 충청북도 음성군 음성읍 설성공원길 10-2 | — | |
| 예수재림교회 [이단] | 충북 괴산군 | 재림교회 | 충청북도 괴산군 괴산읍 읍내로 324 | — | |
| 예수제림교회 | 충북 충주시 | — | 충청북도 충주시 주덕읍 화곡1길 115 | — | |
| 예수제자교회 | 충북 청주시 흥덕구 | — | 충청북도 청주시 흥덕구 옥산면 금계길 35 | — | |
| 예수제자교회 | 충북 청주시 청원구 | 기성 | 충청북도 청주시 청원구 오창읍 중심상업2로 21 | 김주경 목사 | |
| 예수한영혼교회 | 충북 음성군 | — | 충청북도 음성군 대소읍 오태로 109-15 | — | |
| 예수향기교회 | 충북 청주시 서원구 | — | 충청북도 청주시 서원구 구룡산로 292 2층 205호 | — | |
| 예수향기교회 | 충북 제천시 | — | 충청북도 제천시 수산면 인삼로 37-18 | — | |
| 예수향남교회 | 충북 음성군 | — | 충청북도 음성군 맹동면 대하로 295 | — | |
| 예슈아선교교회 | 충북 청주시 흥덕구 | — | 충청북도 청주시 흥덕구 무심서로 623 | — | |
| 예승교회 | 충북 청주시 청원구 | — | 충청북도 청주시 청원구 내수읍 덕암2길 17-21 | — | |
| 예안교회 | 충북 음성군 | 예장통합 | 충청북도 음성군 맹동면 원중로 1434 s타워 3층 | 최규섭 목사 | |