| 아끈교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 애월읍 하소로 638-3 (유수암리) | 김병주 목사 | |
| 아둘람교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 한림읍 금악남2길 145 | — | |
| 아둘람교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 조천읍 신촌남1길 87-2 | — | |
| 아라복음교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 아봉로 42 | — | |
| 아라빌립교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 인다13길 10-8 | — | |
| 아름다운교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 중앙로 457 (아라이동) | 이종한 목사 | |
| 아카페교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 조천읍 함와로 349 | — | |
| 안덕교회 | 제주 서귀포시 | 예장통합 | 제주특별자치도 서귀포시 안덕면 화순재남로 31-18 안덕교회 | 손범수 목사 | |
| 애월교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 애월읍 애월로18길 5 | 오병근 목사 | |
| 애조로교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 애월읍 애조로 88 | — | |
| 양촌교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 애월읍 상가북4길 7 | — | |
| 에덴성회제주교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 한경면 일주서로 4024 | — | |
| 엔게디교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 한림읍 한림로 683 2층 | — | |
| 여의도순복음서귀포교회 | 제주 서귀포시 | 순복음 | 제주특별자치도 서귀포시 일주서로 118 | — | |
| 연동교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 신광로 58 9층 | — | |
| 연동온누리교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 신광로8길 6 | — | |
| 열린교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 한경면 두모리 2328-1 | — | |
| 열린교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 연동6길 13 (연동) | 신상준 목사 | |
| 열린문교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 동홍남로 25 | — | |
| 열린문교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 성지로 63 | — | |
| 열방교회 | 제주 서귀포시 | 예장통합 | 제주특별자치도 서귀포시 중산간동로 8091 (서홍동) | 이성방 목사 | |
| 열방성서침례교회 제주 | 제주 서귀포시 | 성서침례 | 제주특별자치도 서귀포시 안덕면 녹차분재로 44-5 | — | |
| 열방제자교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 부두로 4 | — | |
| 열방제주교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 일주서로 7576 (이호이동) | 이의룡 목사 | |
| 영광교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 아연로 32-4 | — | |
| 영도교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 신산로 109 | 신앙고백 목사 | |
| 영락그리스도의교회 | 제주 서귀포시 | 그리스도의교회 | 제주특별자치도 서귀포시 대정읍 영락중동로16번길 3 | — | |
| 영신교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 계명길 6-1 (외도일동) | 이학식 목사 | |
| 영주교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 동문로 153 (건입동) | 한광섭 목사 | |
| 예래교회 | 제주 서귀포시 | 예장통합 | 제주특별자치도 서귀포시 예래로68번길 8 (상예동) | 강승일 목사 | |
| 예림교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 남원읍 위미중앙로300번길 8 | — | |
| 예림교회 yrch.kr | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 남원읍 위미중앙로300번길 8 예림교회 | — | |
| 예명순복음교회 | 제주 제주시 | 순복음 | 제주특별자치도 제주시 무근성7길 27 | — | |
| 예성교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 하효중앙로 64 | — | |
| 예수그리스도 후기성도교회 서귀포지부 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 솔동산로11번길 20 | — | |
| 예수그리스도 후기성도교회 제주지부 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 삼성로 45 | — | |
| 예수그리스도후기성도교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 신형로 23 | — | |
| 예수랑교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 안덕면 화순중앙로123번길 7 1층 | — | |
| 예수생명교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 서사로 179 2층 | 고경식 목사 | |
| 예수소망교회 | 제주 서귀포시 | 장로교 | 제주특별자치도 서귀포시 중앙로72번길 49-1 | — | |
| 예수제자교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 서광로 238 | — | |
| 예인교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 한림읍 귀덕4길 1 | — | |
| 예인교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 연북로 550 | — | |
| 예초교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 추자면 예초1길 32-7 | 김진석 목사 | |
| 오조교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 성산읍 오조로70번길 11 | — | |
| 온교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 한경면 녹차분재로 505-1 온교회 (저지리) | 주성학 목사 | |
| 온새미로교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 첨단로 199 1층 | 조기쁨 목사 | |
| 온유한교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 중산간서로157번길 56 | — | |
| 온평그리스도의교회 | 제주 서귀포시 | 그리스도의교회 | 제주특별자치도 서귀포시 성산읍 온평애향로23번길 12 | — | |
| 옹포교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 한림읍 옹포8길 1-7 | 김영민 목사 | |