| 서길교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 한림읍 금악서길 27-23 | — | |
| 서림교회 | 제주 서귀포시 | 기장 | 제주특별자치도 서귀포시 대정읍 서림중앙로 45 | 김진성 목사 | |
| 서문로교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 서문로 10 | — | |
| 서부교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 우령8길 2 | — | |
| 서현교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 조천읍 남조로 2044-42 | — | |
| 서호교회 | 제주 서귀포시 | 예장통합 | 제주특별자치도 서귀포시 막동산로 16 (서호동) | 이문순 목사 | |
| 서홍교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 홍중로 141-1 | — | |
| 선율교회 | 제주 제주시 | 장로교 | 제주특별자치도 제주시 애월읍 고성8길 33 | — | |
| 선한길교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 중산간동로 25 2층 | — | |
| 선한목자 교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 표선면 가마행남로 49 | — | |
| 선한믿음교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 서문로 46-1 | — | |
| 선흘교회 | 제주 제주시 | 기감 | 제주특별자치도 제주시 조천읍 동백로 15 | 이규봉 목사 | |
| 선흘중앙교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 조천읍 선화길 36 | 박봉순 목사 | |
| 섬김의집교회 | 제주 서귀포시 | 기감 | 제주특별자치도 서귀포시 동문동로 16-1 (서귀동) | 박장호 목사 | |
| 성광교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 서광로 232-1 | — | |
| 성내교회 | 제주 제주시 | 기장 | 제주특별자치도 제주시 관덕로2길 5 | 진영일 목사 | |
| 성도교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 용담로 93 | — | |
| 성령샘교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 중동로 32-2 | — | |
| 성산교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 성산읍 고성오조로 130 | — | |
| 성산서부교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 성산읍 고성중앙로 50 | — | |
| 성산중앙교회 | 제주 서귀포시 | 기장 | 제주특별자치도 서귀포시 성산읍 난고로 28 | 박성화 목사 | |
| 성산포교회 | 제주 서귀포시 | 예장통합 | 제주특별자치도 서귀포시 성산읍 일출로 294-1 | 김경운 목사 | |
| 성산포순복음교회 | 제주 서귀포시 | 순복음 | 제주특별자치도 서귀포시 성산읍 일출로 18 | — | |
| 성산한사랑교회 | 제주 서귀포시 | 기감 | 제주특별자치도 서귀포시 성산읍 일주동로 5366 (신풍리) | 이현욱 목사 | |
| 성은교회 | 제주 제주시 | 기장 | 제주특별자치도 제주시 용담로 14-1 | 황인생 목사 | |
| 성읍교회 | 제주 서귀포시 | 예장통합 | 제주특별자치도 서귀포시 표선면 성읍정의현로34번길 21 | 김정주 목사 | |
| 성일교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 우령8길 76 | — | |
| 성화교회 | 제주 서귀포시 | 기감 | 제주특별자치도 서귀포시 중앙로 156 (서홍동) 2층 | 이광진 목사 | |
| 세계메시아교 제주교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 설촌로6길 21-1 | — | |
| 세계평화의섬교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 애월읍 평화로 2435 | — | |
| 세광교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 애월읍 광령평화6길 31 | — | |
| 세움교회 | 제주 서귀포시 | 기감 | 제주특별자치도 서귀포시 표선면 돈오름로 198-4 (표선리) | 김종범 목사 | |
| 세한교회 | 제주 서귀포시 | 기장 | 제주특별자치도 서귀포시 중산간동로 8071-5 | 김명택 목사 | |
| 세화교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 구좌읍 세화2길 4-3 | 하태수 목사 | |
| 세화성은감리교회 | 제주 제주시 | 기감 | 제주특별자치도 제주시 구좌읍 세평항로 36 | — | |
| 세화성은교회 | 제주 제주시 | 기감 | 제주특별자치도 제주시 구좌읍 세평항로 36 | 정문연 목사 | |
| 송당교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 구좌읍 중산간동로 2222-2 | 이성규 목사 | |
| 수산교회 | 제주 제주시 | 기감 | 제주특별자치도 제주시 애월읍 수산4길 67 | 최병준 목사 | |
| 순례자의교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 한경면 일주서로 3960-24 | — | |
| 순복음 만남의교회 | 제주 서귀포시 | 순복음 | 제주특별자치도 서귀포시 남원읍 태위로 698 2층 | — | |
| 순복음겨자씨교회 | 제주 제주시 | 순복음 | 제주특별자치도 제주시 동광로9길 16 | — | |
| 순복음제주도중앙교회 | 제주 제주시 | 순복음 | 제주특별자치도 제주시 일주서로 7881 | 금주의 목사 | |
| 순복음제주성령초대교회 | 제주 제주시 | 순복음 | 제주특별자치도 제주시 조천읍 일주동로 762 | — | |
| 순복음청지기교회 | 제주 제주시 | 순복음 | 제주특별자치도 제주시 중앙로 254-1 | — | |
| 순복음풍성한교회 | 제주 제주시 | 순복음 | 제주특별자치도 제주시 진동로5길 45 | — | |
| 쉴만한교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 한림읍 한림중앙로 71-6 쉴만한교회 | 박승미 목사 | |
| 쉼이있는교회 | 제주 제주시 | 예장통합 | 제주특별자치도 제주시 고마로 126 3층 | 안소영 목사 | |
| 시냇가에심은교회 | 제주 서귀포시 | — | 제주특별자치도 서귀포시 중산간동로 7983 | — | |
| 시온교회 | 제주 서귀포시 | 예장통합 | 제주특별자치도 서귀포시 516로 453 (상효동) | 이정우 목사 | |
| 시편교회 | 제주 제주시 | — | 제주특별자치도 제주시 황사평6길 65-5 | — | |